需要，被切掉的部分同样带有粘性末端（因为粘性末端的碱基互补），会干扰目的片段与载体连接。如果不想用胶回收方法纯化，可以选择吸附柱过滤除掉被切掉的小分子片段。胶回收纯化的好处是直观的判断酶切实验结果是否理想，是否酶切完全，胶回收可以避免收集不完全酶切的质粒片段（包括完整的环状质粒和线性质粒）等等。
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