二十年前的自建房只有建房许可证拆迁时和有房产证和土地证的赔的一样吗？

我爸二十年前买了一片空地（现在是市区内，当时不清楚。我爸户口就在这，是城市户口），没有土地证也没有房产证，只有建房许可证，就盖了三间平房。后来想办房产证，但因为没有土地证所以不给办房产证，就没再办。
近两年，我们家又加盖了一层。如果要拆迁，我家的房子受保护吗？不会被强拆吧？有没有相关法规政策，会怎么赔啊？一层和二层一样吗？和我们附近少数有土地证和房产证的赔的会有多少差别啊？
还有，如果我现在想办证，能办到吗？应该先办房产证还是先办土地证啊？得多少钱啊？
（我说的建房许可证是建设工程规划许可证，是1992年的）
急，急，急，请高手答，小弟多谢！