FAT32实际上是文件分区表采取的一种形式，它是相对于FAT16而言的。众所周知，Dos和Windows95采用的都是FAT16格式。至于FAT32，准确地说是在Windows95OSR2中第一次出现的，之所以没有宣传是因为当时该文件系统还不够成熟，尚处于试探阶段。那么为什么一定要推出FAT32呢？这主要是由其自身的优越性决定的。
首先，它可以大大地节约磁盘空间。文件在磁盘上是以簇的方式存放的，簇里存放了一个文件就不能再存放另外的文件。假如一个磁盘的分区大小为512MB，基于FAT16的系统的簇的大小为8KB，而FAT32系统的簇的大小仅是4KB，那么，现在我们存放一个3KB的文件，FAT16系统就会有5KB的空间被浪费，而FAT32的浪费则会少一些。如果分区达到1GB，FAT16的簇为16KB，而FAT32还是4KB，节省的也就更多了。
在推出FAT32文件系统之前，通常PC机使用的文件系统是FAT16。像基于MS-DOS，Win 95等系统都采用了FAT16文件系统。在Win 9X下，FAT16支持的分区最大为2GB。我们知道计算机将信息保存在硬盘上称为“簇”的区域内。使用的簇越小，保存信息的效率就越高。在FAT16的情况下，分区越大簇就相应的要增大，存储效率就越低，势必造成存储空间的浪费。并且随着计算机硬件和应用的不断提高，FAT16文件系统已不能很好地适应系统的要求。在这种情况下，推出了增强的文件系统FAT32。同FAT16相比，FAT32主要具有以下特点：
1. 同FAT16相比FAT32最大的优点是可以支持的磁盘大小达到2TB（2048GB），但是不能支持小于512MB的分区。基于FAT32的Win 2000可以支持分区最大为32GB；而基于 FAT16的Win 2000支持的分区最大为4GB。
2. 由于采用了更小的簇，FAT32文件系统可以更有效率地保存信息。如两个分区大小都为2GB，一个分区采用了FAT16文件系统，另一个分区采用了FAT32文件系统。采用FAT16的分区的簇大小为32KB，而FAT32分区的簇只有4KB的大小。这样FAT32就比FAT16的存储效率要高很多，通常情况下可以提高15%。
3. FAT32文件系统可以重新定位根目录和使用FAT的备份副本。另外FAT32分区的启动记录被包含在一个含有关键数据的结构中，减少了计算机系统崩溃的可能性。
稍作补充：
FAT32 功能
与以前的 FAT 文件系统实现相比，FAT32 提供了以下增强功能： • FAT32 支持最大为 2 TB 的驱动器。
注意：Microsoft Windows 2000 仅能支持最大为 32 GB 的 FAT32 分区。
• FAT32 可以更高效地使用空间。FAT32 使用较小的簇（即，对于大小在 8 GB 以内的驱动器，使用 4 KB 的簇），这与大的 FAT 或 FAT16 驱动器相比，可将磁盘空间的使用率提高 10% 到 15%。
• FAT32 更稳定可靠。FAT32 可以重新定位根文件夹，而且它使用文件分配表的备份副本，而不是使用默认副本。此外，FAT32 驱动器上的引导记录也得到扩展，包括了关键数据结构的备份副本。因此，与现有的 FAT16 驱动器相比，FAT32 驱动器不容易受单点故障的影响。
• FAT32 更灵活。FAT32 驱动器上的根文件夹是普通的簇链，因此它可以位于驱动器上的任何位置。以前对根文件夹数量的限制不复存在。此外，可以禁用文件分配表镜像，这样就可以让文件分配表的副本而不是让第一个文件分配表处于活动状态。这些功能允许您动态重调 FAT32 分区的大小。不过要注意，虽然 FAT32 的设计允许这一功能，但 Microsoft 将不在初始版本中实现此功能。
FAT32 兼容性注意事项
为了与现有程序、网络和设备驱动程序保持最大程度的兼容性，FAT32 尽可能不改动现有的 Windows 体系结构、内部数据结构、应用程序编程接口 (API) 和磁盘上的格式。然而，因为现在需要 4 字节来存储簇值，所以许多内部的和磁盘上的数据结构以及发布的 API 都作了修改或扩展。某些情况下，现有的 API 无法在 FAT32 驱动器上运行。大多数程序不会受这些更改的影响。现有工具和驱动程序在 FAT32 驱动器上应能够继续正常运行。不过，MS-DOS 块设备驱动程序（例如 Aspidisk.sys）和磁盘工具需要经过修改才能支持 FAT32 驱动器。
所有 Microsoft 捆绑磁盘工具（格式化、Fdisk、碎片整理、基于 MS-DOS 和 Windows 的磁盘扫描）已经过修改，可以在 FAT32 中正常运行。此外，Microsoft 正在与一些主要设备驱动程序和磁盘工具厂商协作，帮助他们修改其产品以支持 FAT32。
注意：不能使用 Microsoft DriveSpace 或 DriveSpace 3 压缩 FAT32 卷。
FAT32 性能
转换到 FAT32 文件系统是您可以在基于 Windows 98 的计算机上实现的最大的一种性能增强。
双启动计算机
目前，在 Microsoft 操作系统中，只有 Windows 95 OSR2、Windows 98、Windows 2000 和 Windows Me 可以访问 FAT32 卷。MS-DOS、Windows 95 原始版和 Windows NT 4.0 不识别 FAT32 分区，它们无法从 FAT32 卷启动。此外，如果使用其他操作系统（例如，Windows 95 或 MS-DOS 启动盘）启动计算机，也无法正确访问 FAT32 卷。
Windows 95 OSR2 和 Windows 98 可以在实模式下启动（例如为了运行游戏）并可以使用 FAT32 卷。
创建 FAT32 驱动器
在 Windows 95 OSR2、Windows 98 和 Windows Me 中，如果在大小超过 512 兆字节 (MB) 的硬盘上运行 Fdisk 工具，Fdisk 将提示您是否启用大磁盘支持。如果回答“是”（启用大磁盘支持），您创建的任何大于 512 MB 的分区都将被标记为 FAT32 分区。
Windows 98 和 Windows Me 中还带有一种 FAT32 转换工具，您可以使用该工具将现有驱动器转换为 FAT32 文件系统。要使用该转换工具，请按照下列步骤操作： 1. 单击开始，依次指向程序、附件、系统工具，然后单击驱动器转换器 (FAT32)。
2. 单击下一步。
3. 单击希望转换为 FAT32 文件系统的驱动器，然后单击下一步。
4. 按照屏幕上的说明操作。
支持范围
Microsoft 将支持 FAT32 文件系统的功能，以实现无错读取和在实模式或保护模式下保存文件。Microsoft 支持 Windows 95 中所带的实模式和保护模式工具。
对于旧式（较早的）程序，如果它们无法在 FAT32 卷上安装，或者无法正确保存文件或读取文件，则您必须与软件包的生产厂商联系。
注意：虽然 FAT32 文件系统所支持的硬盘容量最高可以达到 2 TB，但有些硬盘可能会因为计算机基本输入/输出系统 (BIOS) INT13 接口的限制而无法包含大于 7.8 GB 的可启动分区。请与硬件制造商联系，以确定您计算机的 BIOS 是否支持更新后的 INT13 扩展。
http://support.microsoft.com/default.aspx?scid=kb;zh-cn;184006
Windows 操作系统使用 FAT32 文件系统时存在以下限制： • 簇不能是 64 千字节 (KB) 或更大。如果簇为 64 KB 或更大，有些程序（例如安装程序）在计算磁盘空间时可能会出错。
• 卷必须包含至少 65,527 个簇，才能使用 FAT32 文件系统。您不能增加使用 FAT32 文件系统的卷上的簇大小，以致于该卷的最终簇数小于 65,527。
• 在使用 FAT32 文件系统的卷上，簇最多是 268,435,445 个。对于文件分配表 (FAT) 的空间，每簇最大为 32 KB，据此计算出的最大磁盘大小大约为 8 太字节 (TB)。
• Microsoft Windows 95 和 Microsoft Windows 98 附带的“磁盘扫描”工具是 16 位程序。这样的程序有一个内存块，该内存块的最大分配大小等于 16 MB 减去 64 KB。因此，Windows 95 或 Windows 98 的“磁盘扫描”工具无法处理使用 FAT32 文件系统（其 FAT 大小大于 16 MB 和 64 KB 之差）的卷。使用 FAT32 文件系统的卷上的 FAT 项使用 4 字节，因此 ScanDisk 无法处理使用定义的簇数大于 4,177,920（包括两个保留的簇）的 FAT32 文件系统的卷上的 FAT。将 FAT 本身包括在内，按每簇最大 32 KB 计算，卷大小为 127.53 吉字节 (GB)。
• 您不能减少使用 FAT32 文件系统的卷上的簇大小，以致于 FAT 的最终大小大于 16 MB 与 64 KB 之差。
• 在 Windows 2000 中您无法使用 FAT32 文件系统格式化大于 32 GB 的卷。Windows 2000 FastFAT 驱动程序可以安装和支持使用 FAT32 文件系统且大于 32 GB的卷（受到其他限制），但是您不能使用格式化工具创建一个这样的卷。这种现象是设计使然。如果需要创建大于 32 GB 的卷，请改用 NTFS 文件系统。
备注：在尝试格式化大于 32 GB 的 FAT32 分区时，在进程快结束时格式化会失败，并出现以下错误：
Logical Disk Manager:Volume size too big.
http://support.microsoft.com/default.aspx?scid=kb;zh-cn;314463
Windows XP 中 FAT32 文件系统的限制
当您在 Windows XP 中使用 FAT32 文件系统时，请注意下列限制： • 簇不能等于或大于 64 KB。如果簇大小为 64 KB 或更大，则有些程序（例如安装程序）可能会不正确地计算磁盘空间。
• FAT32 卷必须至少包含 65,527 个簇。您不能增加使用 FAT32 文件系统的卷上的簇大小，这样会导致卷上的簇数少于 65,527 个。
• 如果考虑到以下可变因素，则最大磁盘大小大约为 8 TB：一个 FAT32 卷上允许的最大簇数为 268,435,445，每个簇最大为 32 KB，另外还有文件分配表 (FAT) 所需的空间。
• 您不能减少 FAT32 卷上的簇大小，这样会导致 FAT 的大小大于 16 MB 减去 64 KB。
• 在 Windows XP 安装过程中，您不能使用 FAT32 文件系统格式化大于 32 GB 的卷。Windows XP 可以装入和支持大于 32 GB 的 FAT32 卷（受到其他限制），但是您不能在安装期间使用 Format 工具创建大于 32 GB 的 FAT32 卷。如果您需要格式化大于 32 GB 的卷，请使用 NTFS 文件系统来格式化。另一种方法是从 Microsoft Windows 98 或 Microsoft Windows Millennium Edition (Me) 启动盘启动，然后使用该磁盘上包含的 Format 工具。
有关如何使用 Microsoft Windows 98 或 Microsoft Windows Millennium Edition (Me) 启动盘格式化硬盘的其他信息，请单击下面的文章编号，以查看 Microsoft 知识库中相应的文章：
255867 如何使用 Fdisk 和 Format 工具对硬盘进行分区或重新分区
注意：当您在 Windows XP 安装过程中试图格式化大于 32GB 的 FAT32 分区时，在格式化过程快结束时操作将会失败，并且您可能会收到以下错误信息：
Logical Disk Manager:Volume size too big.
• MS-DOS（Microsoft Windows 95 的原始版本）和 Microsoft Windows NT 4.0 及更低版本都不能识别 FAT32 分区，因此无法从 FAT32 卷启动。
• 您不能在 FAT32 分区上创建大于 (2^32)-1 字节（即 4 GB 减去 1 个字节）的文件。
FAT32格式理论上可以支持128TB的磁盘，即簇的大小乘簇的数量32K*(2^32),但由于受到软硬件的限制和其他方面的原因，不可能达到理论值。
NTFS概述
NTFS 是 Windows NT 操作环境和 Windows NT 高级服务器网络操作系统环境的文件系统。NTFS 的目标是提供：可靠性，通过可恢复能力(事件跟踪)和热定位的容错特征实现；增加功能性的一个平台；对 POSIX 需求的支持；消除 FAT 和 HPFS 文件系统中的限制。
NTFS 提供长文件名、数据保护和恢复，并通过目录和文件许可实现安全性。NTFS 支持大硬盘和在多个硬盘上存储文件(称为跨越分区)。例如，一个大公司的数据库可能大得必须跨越不同的硬盘。NTFS 提供内置安全性特征，它控制文件的隶属关系和访问。从 DOS 或其他操作系统上不能直接访问 NTFS 分区上的文件。如果要在DOS下读写NTFS分区文件的话可以借助第三方软件；现如今，Linux 系统上已可以使用 NTFS-3G 进行对 NTFS 分区的完美读写，不必担心数据丢失。这是Windows NT 安全性系统的一部分，但是，只有在使用 NTFS 时才是这样。
Win 2000采用了更新版本的NTFS文件系统NTFS 5.0，它的推出使得用户不但可以像Win 9X那样方便快捷地操作和管理计算机，同时也可享受到NTFS所带来的系统安全性。 NTFS 允许文件名的长度可达 256 个字符。虽然 DOS 用户不能访问 NTFS 分区，但是 NTFS 文件可以拷贝到 DOS 分区。每个 NTFS 文件包含一个可被 DOS 文件名格式认可的 DOS 可读文件名。这个文件名是 NTFS 从长文件名的开始字符中产生的。
convert命令将FAT32无损转成NTFS格式
将FAT 卷转换成 NTFS。 CONVERT volume /FS:NTFS [/V] [/CvtArea:filename] [/NoSecurity] [/X] volume 指定驱动器号(后面跟一个冒号)、 装载点或卷名，但不能反过来无损操作。
NTFS的特点
·NTFS可以支持的分区(如果采用动态磁盘则称为卷)大小可以达到2TB。而Win 2000中的FAT32支持分区的大小最大为32GB。
·NTFS是一个可恢复的文件系统。在NTFS分区上用户很少需要运行磁盘修复程序。NTFS通过使用标准的事物处理日志和恢复技术来保证分区的一致性。发生系统失败事件时，NTFS使用日志文件和检查点信息自动恢复文件系统的一致性。
·NTFS支持对分区、文件夹和文件的压缩。任何基于Windows的应用程序对NTFS分区上的压缩文件进行读写时不需要事先由其他程序进行解压缩，当对文件进行读取时,文件将自动进行解压缩；文件关闭或保存时会自动对文件进行压缩。
·NTFS采用了更小的簇,可以更有效率地管理磁盘空间。在Win 2000的FAT32文件系统的情况下,分区大小在2GB～8GB时簇的大小为4KB；分区大小在8GB～16GB时簇的大小为8KB；分区大小在16GB～32GB时,簇的大小则达到了16KB。而Win 2000的NTFS文件系统，当分区的大小在2GB以下时,簇的大小都比相应的FAT32簇小;当分区的大小在2GB以上时(2GB～2TB),簇的大小都为4KB。相比之下，NTFS可以比FAT32更有效地管理磁盘空间，最大限度地避免了磁盘空间的浪费。
·在NTFS分区上,可以为共享资源、文件夹以及文件设置访问许可权限。许可的设置包括两方面的内容：一是允许哪些组或用户对文件夹、文件和共享资源进行访问；二是获得访问许可的组或用户可以进行什么级别的访问。访问许可权限的设置不但适用于本地计算机的用户,同样也应用于通过网络的共享文件夹对文件进行访问的网络用户。与FAT32文件系统下对文件夹或文件进行访问相比，安全性要高得多。另外,在采用NTFS格式的Win 2000中,应用审核策略可以对文件夹、文件以及活动目录对象进行审核，审核结果记录在安全日志中，通过安全日志就可以查看哪些组或用户对文件夹、文件或活动目录对象进行了什么级别的操作，从而发现系统可能面临的非法访问,通过采取相应的措施，将这种安全隐患减到最低。这些在FAT32文件系统下,是不能实现的。
·在Win 2000的NTFS文件系统下可以进行磁盘配额管理。磁盘配额就是管理员可以为用户所能使用的磁盘空间进行配额限制，每一用户只能使用最大配额范围内的磁盘空间。设置磁盘配额后，可以对每一个用户的磁盘使用情况进行跟踪和控制，通过监测可以标识出超过配额报警阈值和配额限制的用户，从而采取相应的措施。磁盘配额管理功能的提供，使得管理员可以方便合理地为用户分配存储资源，避免由于磁盘空间使用的失控可能造成的系统崩溃，提高了系统的安全性。
·NTFS使用一个“变更”日志来跟踪记录文件所发生的变更。
·还有诸如加密文件数据等等，和系统服务相关的东西不少。
NTFS的优点
1.具备错误预警的文件系统
在NTFS分区中，最开始的16个扇区是分区引导扇区，其中保存着分区引导代码，接着就是主文件表(Master File Table，以下简称MFT)，但如果它所在的磁盘扇区恰好出现损坏，NTFS文件系统会比较智能地将MFT换到硬盘的其他扇区，保证了文件系统的正常使用，也就是保证了Windows的正常运行。而以前的FAT16和FAT32的FAT(文件分配表)则只能固定在分区引导扇区的后面，一旦遇到扇区损坏，那么整个文件系统就要瘫痪。
但这种智能移动MFT的做法当然并非十全十美，如果分区引导代码中指向MFT的部分出现错误，那么NTFS文件系统便会不知道到哪里寻找MFT，从而会报告“磁盘没有格式化”这样的错误信息。为了避免这样的问题发生，分区引导代码中会包含一段校验程序，专门负责侦错。
2.文件读取速度更高效
恐怕很多人都听说NTFS文件系统在安全性方面有很多新功能，但你可否知道:NTFS在文件处理速度上也比FAT32大有提升呢?
对DOS略知一二的读者一定熟悉文件的各种属性:只读、隐藏、系统等。在NTFS文件系统中，这些属性都还存在，但有了很大不同。在这里，一切东西都是一种属性，就连文件内容也是一种属性。这些属性的列表不是固定的，可以随时增加，这也就是为什么你会在NTFS分区上看到文件有更多的属性.
NTFS文件系统中的文件属性可以分成两种:常驻属性和非常驻属性，常驻属性直接保存在MFT中，像文件名和相关时间信息(例如创建时间、修改时间等)永远属于常驻属性，非常驻属性则保存在MFT之外，但会使用一种复杂的索引方式来进行指示。如果文件或文件夹小于1500字节(其实我们的电脑中有相当多这样大小的文件或文件夹)，那么它们的所有属性，包括内容都会常驻在MFT中，而MFT是Windows一启动就会载入到内存中的，这样当你查看这些文件或文件夹时，其实它们的内容早已在缓存中了，自然大大提高了文件和文件夹的访问速度。
3.磁盘自我修复功能
NTFS利用一种“自我疗伤”的系统，可以对硬盘上的逻辑错误和物理错误进行自动侦测和修复。在FAT16和FAT32时代，我们需要借助Scandisk这个程序来标记磁盘上的坏扇区，但当发现错误时，数据往往已经被写在了坏的扇区上了，损失已经造成。
NTFS文件系统则不然，每次读写时，它都会检查扇区正确与否。当读取时发现错误，NTFS会报告这个错误;当向磁盘写文件时发现错误，NTFS将会十分智能地换一个完好位置存储数据，操作不会受到任何影响。在这两种情况下，NTFS都会在坏扇区上作标记，以防今后被使用。这种工作模式可以使磁盘错误可以较早地被发现，避免灾难性的事故发生。
有些人发现当把磁盘转换为NTFS文件系统后，用磁盘扫描程序就很难发现磁盘错误了。经过前面的介绍，你知道这是为什么了吗?
4.“防灾赈灾”的事件日志功能
在NTFS文件系统中，任何操作都可以被看成是一个“事件”。比如将一个文件从C盘复制到D盘，整个复制过程就是一个事件。事件日志一直监督着整个操作，当它在目标地——D盘发现了完整文件，就会记录下一个“已完成”的标记。假如复制中途断电，事件日志中就不会记录“已完成”，NTFS可以在来电后重新完成刚才的事件。事件日志的作用不在于它能挽回损失，而在于它监督所有事件，从而让系统永远知道完成了哪些任务，那些任务还没有完成，保证系统不会因为断电等突发事件发生紊乱，最大程度降低了破坏性。
5.我是否需要哪些附加的功能?
其实，NTFS还提供了磁盘压缩、数据加密、磁盘配额(在“我的电脑”中右击分区并并行“属性”，进入“配额”选项卡即可设置)、动态磁盘管理等功能，这些功能在很多报刊杂志上介绍的比较多了，这里不再详细介绍。
NTFS提供了为不同用户设置不同访问控制、隐私和安全管理功能。如果你的系统处于一个单机环境，比如家用电脑，那么这些功能对你意义不是很大。
NTFS使用注意事项
NTFS是微软Windows NT内核的系列操作系统支持的、一个特别为网络和磁盘配额、文件加密等管理安全特性设计的磁盘格式。除了在局域网安装了NT系列的用户们使用NTFS外，随着NT内核的桌面系统Windows2000和XP的普及，很多个人用户也开始把自己的分区格式化为NTFS。
在一般情况下，NTFS的格式不能被Windows9X识别，而且在安装、操作方面也有差异，所以个人用户在使用这种磁盘格式的时候，必须留意下面的注意事项：
一、NT内核的系统应始终使用NTFS 吗？
NTFS是微软推荐在NT系列上使用的文件系统，但是，会有一些特殊的原因使用其他文件系统。如果计划用其他操作系统（包括 MS-DOS）访问文件，则应把引导的分区，即C盘选择格式为 FAT（包括FAT32）文件系统。如果使用的是NTFS文件系统并要与Windows NT进行双重引导，那么在继续Windows 2000或XP的安装之前，必须要为Windows NT安装SP4或更高版本的补丁。
二、转化NTFS和其他分区格式的技巧
一台机器用PQ7把一个分区由NTFS转换成FAT32格式，完成后发现该盘中的中文名的文件夹全部变成问号，打不开了。此时想转回来时发现提示磁盘错误，用Windows的磁盘扫描和DOS的CHKDSK检查后仍无法转换，里面有其下载的几百M的文件，现在已经搞的面目全非了。
其实，如果NTFS的分区容量很大且内有大量的数据存在的话，用直接转换的方式不仅缓慢，而且是很危险的——因为在每一个步骤里，转换的工具程序都要先读取扇区信息、拷贝到临时目录、转化格式再从临时目录读数据重新写入转换好的空间，再校验……这样的操作其实和低级格式化硬盘或是刷新主板的BIOS差不多危险，一旦发生掉电或是瞬间的数据量过大传输溢出缓冲区导致的死机，重新开机后可能就会丢失分区的所有信息，或是破坏引导区数据甚至是损坏硬盘。
如果硬盘其他分区有足够的空间，用拷贝后删除文件再转化的方法，会事半功倍。具体的操作就是先在其他分区建立一个目录，然后转到你的NTFS分区，选定全部文件，用复制粘贴的方法进行转移数据。然后把NTFS分区的数据清空，再进行转化格式就快很多，也安全得多了；从FAT的格式转换到NTFS也是一样道理。这种拷贝，比直接转换分区格式读读写写、又校验数据的那种繁琐过程快很多，可以在转换完成后，把数据拷贝回该分区。
另外，建议在清空数据后，利用GHOST镜像NTFS或FAT格式的空白分区，得到一个备份文件，以后如果再要转换分区格式利用它来进行就更快。
三、虚拟内存（页面文件）与NTFS的卷
现在很多人装了双硬盘系统甚至是简单的RAID磁盘阵列，在使用这种结构的系统同时是需要NTFS支持卷功能的，此时，应该尽量避免页面文件和系统文件在同一分区上，也不要在同一物理磁盘驱动器的不同分区中放置多个页面文件。特别注意避免将页面文件放入容错驱动器，例如镜像卷或 RAID-5 卷，因为页面文件不需要容错，而且一些容错系统将数据写到多个位置，会导致非常缓慢的数据写操作。
四、如果使用了虚拟机或是磁盘压缩，不适宜使用NTFS格式
使用虚拟机时，在NTFS分区引导的机器上使用光盘引导后，在装操作系统的时候，将会出现以下提示：
Please wait while Setup initializes.
Scanning system registry...
Cannot create a temporary directory.
If you have HPFS or NTFS installed on your hard drive， you will need to create an MS-DOS boot partition to set up Windows.
因为虚拟机出于兼容的考虑，只内置了最常用的硬件和软件支持，对NTFS格式的支持目前还不是很好。如果你使用Windows9X加补丁的方式来读写NTFS分区的话，也可能会导致某些长文件名或是中文名的文件结构被破坏；在使用GHOST备份和恢复的时候也可能会出现莫名其妙的错误。所以，上NTFS还是用NT内核的系列视窗系统好。
另外，注意压缩过的分区不能转化为NTFS。其实压缩磁盘分区变相增大容量是以系统速度的极大牺牲为代价的；而且还会给以后的系统维护、转换分区格式、升级操作系统等等带来很大麻烦。除非是完全出于备份数据的考虑，其他的应用建议不要使用Windows的分区磁盘压缩功能。
首先，它可以大大地节约磁盘空间。文件在磁盘上是以簇的方式存放的，簇里存放了一个文件就不能再存放另外的文件。假如一个磁盘的分区大小为512MB，基于FAT16的系统的簇的大小为8KB，而FAT32系统的簇的大小仅是4KB，那么，现在我们存放一个3KB的文件，FAT16系统就会有5KB的空间被浪费，而FAT32的浪费则会少一些。如果分区达到1GB，FAT16的簇为16KB，而FAT32还是4KB，节省的也就更多了。
在推出FAT32文件系统之前，通常PC机使用的文件系统是FAT16。像基于MS-DOS，Win 95等系统都采用了FAT16文件系统。在Win 9X下，FAT16支持的分区最大为2GB。我们知道计算机将信息保存在硬盘上称为“簇”的区域内。使用的簇越小，保存信息的效率就越高。在FAT16的情况下，分区越大簇就相应的要增大，存储效率就越低，势必造成存储空间的浪费。并且随着计算机硬件和应用的不断提高，FAT16文件系统已不能很好地适应系统的要求。在这种情况下，推出了增强的文件系统FAT32。同FAT16相比，FAT32主要具有以下特点：
1. 同FAT16相比FAT32最大的优点是可以支持的磁盘大小达到2TB（2048GB），但是不能支持小于512MB的分区。基于FAT32的Win 2000可以支持分区最大为32GB；而基于 FAT16的Win 2000支持的分区最大为4GB。
2. 由于采用了更小的簇，FAT32文件系统可以更有效率地保存信息。如两个分区大小都为2GB，一个分区采用了FAT16文件系统，另一个分区采用了FAT32文件系统。采用FAT16的分区的簇大小为32KB，而FAT32分区的簇只有4KB的大小。这样FAT32就比FAT16的存储效率要高很多，通常情况下可以提高15%。
3. FAT32文件系统可以重新定位根目录和使用FAT的备份副本。另外FAT32分区的启动记录被包含在一个含有关键数据的结构中，减少了计算机系统崩溃的可能性。
稍作补充：
FAT32 功能
与以前的 FAT 文件系统实现相比，FAT32 提供了以下增强功能： • FAT32 支持最大为 2 TB 的驱动器。
注意：Microsoft Windows 2000 仅能支持最大为 32 GB 的 FAT32 分区。
• FAT32 可以更高效地使用空间。FAT32 使用较小的簇（即，对于大小在 8 GB 以内的驱动器，使用 4 KB 的簇），这与大的 FAT 或 FAT16 驱动器相比，可将磁盘空间的使用率提高 10% 到 15%。
• FAT32 更稳定可靠。FAT32 可以重新定位根文件夹，而且它使用文件分配表的备份副本，而不是使用默认副本。此外，FAT32 驱动器上的引导记录也得到扩展，包括了关键数据结构的备份副本。因此，与现有的 FAT16 驱动器相比，FAT32 驱动器不容易受单点故障的影响。
• FAT32 更灵活。FAT32 驱动器上的根文件夹是普通的簇链，因此它可以位于驱动器上的任何位置。以前对根文件夹数量的限制不复存在。此外，可以禁用文件分配表镜像，这样就可以让文件分配表的副本而不是让第一个文件分配表处于活动状态。这些功能允许您动态重调 FAT32 分区的大小。不过要注意，虽然 FAT32 的设计允许这一功能，但 Microsoft 将不在初始版本中实现此功能。
FAT32 兼容性注意事项
为了与现有程序、网络和设备驱动程序保持最大程度的兼容性，FAT32 尽可能不改动现有的 Windows 体系结构、内部数据结构、应用程序编程接口 (API) 和磁盘上的格式。然而，因为现在需要 4 字节来存储簇值，所以许多内部的和磁盘上的数据结构以及发布的 API 都作了修改或扩展。某些情况下，现有的 API 无法在 FAT32 驱动器上运行。大多数程序不会受这些更改的影响。现有工具和驱动程序在 FAT32 驱动器上应能够继续正常运行。不过，MS-DOS 块设备驱动程序（例如 Aspidisk.sys）和磁盘工具需要经过修改才能支持 FAT32 驱动器。
所有 Microsoft 捆绑磁盘工具（格式化、Fdisk、碎片整理、基于 MS-DOS 和 Windows 的磁盘扫描）已经过修改，可以在 FAT32 中正常运行。此外，Microsoft 正在与一些主要设备驱动程序和磁盘工具厂商协作，帮助他们修改其产品以支持 FAT32。
注意：不能使用 Microsoft DriveSpace 或 DriveSpace 3 压缩 FAT32 卷。
FAT32 性能
转换到 FAT32 文件系统是您可以在基于 Windows 98 的计算机上实现的最大的一种性能增强。
双启动计算机
目前，在 Microsoft 操作系统中，只有 Windows 95 OSR2、Windows 98、Windows 2000 和 Windows Me 可以访问 FAT32 卷。MS-DOS、Windows 95 原始版和 Windows NT 4.0 不识别 FAT32 分区，它们无法从 FAT32 卷启动。此外，如果使用其他操作系统（例如，Windows 95 或 MS-DOS 启动盘）启动计算机，也无法正确访问 FAT32 卷。
Windows 95 OSR2 和 Windows 98 可以在实模式下启动（例如为了运行游戏）并可以使用 FAT32 卷。
创建 FAT32 驱动器
在 Windows 95 OSR2、Windows 98 和 Windows Me 中，如果在大小超过 512 兆字节 (MB) 的硬盘上运行 Fdisk 工具，Fdisk 将提示您是否启用大磁盘支持。如果回答“是”（启用大磁盘支持），您创建的任何大于 512 MB 的分区都将被标记为 FAT32 分区。
Windows 98 和 Windows Me 中还带有一种 FAT32 转换工具，您可以使用该工具将现有驱动器转换为 FAT32 文件系统。要使用该转换工具，请按照下列步骤操作： 1. 单击开始，依次指向程序、附件、系统工具，然后单击驱动器转换器 (FAT32)。
2. 单击下一步。
3. 单击希望转换为 FAT32 文件系统的驱动器，然后单击下一步。
4. 按照屏幕上的说明操作。
支持范围
Microsoft 将支持 FAT32 文件系统的功能，以实现无错读取和在实模式或保护模式下保存文件。Microsoft 支持 Windows 95 中所带的实模式和保护模式工具。
对于旧式（较早的）程序，如果它们无法在 FAT32 卷上安装，或者无法正确保存文件或读取文件，则您必须与软件包的生产厂商联系。
注意：虽然 FAT32 文件系统所支持的硬盘容量最高可以达到 2 TB，但有些硬盘可能会因为计算机基本输入/输出系统 (BIOS) INT13 接口的限制而无法包含大于 7.8 GB 的可启动分区。请与硬件制造商联系，以确定您计算机的 BIOS 是否支持更新后的 INT13 扩展。
http://support.microsoft.com/default.aspx?scid=kb;zh-cn;184006
Windows 操作系统使用 FAT32 文件系统时存在以下限制： • 簇不能是 64 千字节 (KB) 或更大。如果簇为 64 KB 或更大，有些程序（例如安装程序）在计算磁盘空间时可能会出错。
• 卷必须包含至少 65,527 个簇，才能使用 FAT32 文件系统。您不能增加使用 FAT32 文件系统的卷上的簇大小，以致于该卷的最终簇数小于 65,527。
• 在使用 FAT32 文件系统的卷上，簇最多是 268,435,445 个。对于文件分配表 (FAT) 的空间，每簇最大为 32 KB，据此计算出的最大磁盘大小大约为 8 太字节 (TB)。
• Microsoft Windows 95 和 Microsoft Windows 98 附带的“磁盘扫描”工具是 16 位程序。这样的程序有一个内存块，该内存块的最大分配大小等于 16 MB 减去 64 KB。因此，Windows 95 或 Windows 98 的“磁盘扫描”工具无法处理使用 FAT32 文件系统（其 FAT 大小大于 16 MB 和 64 KB 之差）的卷。使用 FAT32 文件系统的卷上的 FAT 项使用 4 字节，因此 ScanDisk 无法处理使用定义的簇数大于 4,177,920（包括两个保留的簇）的 FAT32 文件系统的卷上的 FAT。将 FAT 本身包括在内，按每簇最大 32 KB 计算，卷大小为 127.53 吉字节 (GB)。
• 您不能减少使用 FAT32 文件系统的卷上的簇大小，以致于 FAT 的最终大小大于 16 MB 与 64 KB 之差。
• 在 Windows 2000 中您无法使用 FAT32 文件系统格式化大于 32 GB 的卷。Windows 2000 FastFAT 驱动程序可以安装和支持使用 FAT32 文件系统且大于 32 GB的卷（受到其他限制），但是您不能使用格式化工具创建一个这样的卷。这种现象是设计使然。如果需要创建大于 32 GB 的卷，请改用 NTFS 文件系统。
备注：在尝试格式化大于 32 GB 的 FAT32 分区时，在进程快结束时格式化会失败，并出现以下错误：
Logical Disk Manager:Volume size too big.
http://support.microsoft.com/default.aspx?scid=kb;zh-cn;314463
Windows XP 中 FAT32 文件系统的限制
当您在 Windows XP 中使用 FAT32 文件系统时，请注意下列限制： • 簇不能等于或大于 64 KB。如果簇大小为 64 KB 或更大，则有些程序（例如安装程序）可能会不正确地计算磁盘空间。
• FAT32 卷必须至少包含 65,527 个簇。您不能增加使用 FAT32 文件系统的卷上的簇大小，这样会导致卷上的簇数少于 65,527 个。
• 如果考虑到以下可变因素，则最大磁盘大小大约为 8 TB：一个 FAT32 卷上允许的最大簇数为 268,435,445，每个簇最大为 32 KB，另外还有文件分配表 (FAT) 所需的空间。
• 您不能减少 FAT32 卷上的簇大小，这样会导致 FAT 的大小大于 16 MB 减去 64 KB。
• 在 Windows XP 安装过程中，您不能使用 FAT32 文件系统格式化大于 32 GB 的卷。Windows XP 可以装入和支持大于 32 GB 的 FAT32 卷（受到其他限制），但是您不能在安装期间使用 Format 工具创建大于 32 GB 的 FAT32 卷。如果您需要格式化大于 32 GB 的卷，请使用 NTFS 文件系统来格式化。另一种方法是从 Microsoft Windows 98 或 Microsoft Windows Millennium Edition (Me) 启动盘启动，然后使用该磁盘上包含的 Format 工具。
有关如何使用 Microsoft Windows 98 或 Microsoft Windows Millennium Edition (Me) 启动盘格式化硬盘的其他信息，请单击下面的文章编号，以查看 Microsoft 知识库中相应的文章：
255867 如何使用 Fdisk 和 Format 工具对硬盘进行分区或重新分区
注意：当您在 Windows XP 安装过程中试图格式化大于 32GB 的 FAT32 分区时，在格式化过程快结束时操作将会失败，并且您可能会收到以下错误信息：
Logical Disk Manager:Volume size too big.
• MS-DOS（Microsoft Windows 95 的原始版本）和 Microsoft Windows NT 4.0 及更低版本都不能识别 FAT32 分区，因此无法从 FAT32 卷启动。
• 您不能在 FAT32 分区上创建大于 (2^32)-1 字节（即 4 GB 减去 1 个字节）的文件。
FAT32格式理论上可以支持128TB的磁盘，即簇的大小乘簇的数量32K*(2^32),但由于受到软硬件的限制和其他方面的原因，不可能达到理论值。
NTFS概述
NTFS 是 Windows NT 操作环境和 Windows NT 高级服务器网络操作系统环境的文件系统。NTFS 的目标是提供：可靠性，通过可恢复能力(事件跟踪)和热定位的容错特征实现；增加功能性的一个平台；对 POSIX 需求的支持；消除 FAT 和 HPFS 文件系统中的限制。
NTFS 提供长文件名、数据保护和恢复，并通过目录和文件许可实现安全性。NTFS 支持大硬盘和在多个硬盘上存储文件(称为跨越分区)。例如，一个大公司的数据库可能大得必须跨越不同的硬盘。NTFS 提供内置安全性特征，它控制文件的隶属关系和访问。从 DOS 或其他操作系统上不能直接访问 NTFS 分区上的文件。如果要在DOS下读写NTFS分区文件的话可以借助第三方软件；现如今，Linux 系统上已可以使用 NTFS-3G 进行对 NTFS 分区的完美读写，不必担心数据丢失。这是Windows NT 安全性系统的一部分，但是，只有在使用 NTFS 时才是这样。
Win 2000采用了更新版本的NTFS文件系统NTFS 5.0，它的推出使得用户不但可以像Win 9X那样方便快捷地操作和管理计算机，同时也可享受到NTFS所带来的系统安全性。 NTFS 允许文件名的长度可达 256 个字符。虽然 DOS 用户不能访问 NTFS 分区，但是 NTFS 文件可以拷贝到 DOS 分区。每个 NTFS 文件包含一个可被 DOS 文件名格式认可的 DOS 可读文件名。这个文件名是 NTFS 从长文件名的开始字符中产生的。
convert命令将FAT32无损转成NTFS格式
将FAT 卷转换成 NTFS。 CONVERT volume /FS:NTFS [/V] [/CvtArea:filename] [/NoSecurity] [/X] volume 指定驱动器号(后面跟一个冒号)、 装载点或卷名，但不能反过来无损操作。
NTFS的特点
·NTFS可以支持的分区(如果采用动态磁盘则称为卷)大小可以达到2TB。而Win 2000中的FAT32支持分区的大小最大为32GB。
·NTFS是一个可恢复的文件系统。在NTFS分区上用户很少需要运行磁盘修复程序。NTFS通过使用标准的事物处理日志和恢复技术来保证分区的一致性。发生系统失败事件时，NTFS使用日志文件和检查点信息自动恢复文件系统的一致性。
·NTFS支持对分区、文件夹和文件的压缩。任何基于Windows的应用程序对NTFS分区上的压缩文件进行读写时不需要事先由其他程序进行解压缩，当对文件进行读取时,文件将自动进行解压缩；文件关闭或保存时会自动对文件进行压缩。
·NTFS采用了更小的簇,可以更有效率地管理磁盘空间。在Win 2000的FAT32文件系统的情况下,分区大小在2GB～8GB时簇的大小为4KB；分区大小在8GB～16GB时簇的大小为8KB；分区大小在16GB～32GB时,簇的大小则达到了16KB。而Win 2000的NTFS文件系统，当分区的大小在2GB以下时,簇的大小都比相应的FAT32簇小;当分区的大小在2GB以上时(2GB～2TB),簇的大小都为4KB。相比之下，NTFS可以比FAT32更有效地管理磁盘空间，最大限度地避免了磁盘空间的浪费。
·在NTFS分区上,可以为共享资源、文件夹以及文件设置访问许可权限。许可的设置包括两方面的内容：一是允许哪些组或用户对文件夹、文件和共享资源进行访问；二是获得访问许可的组或用户可以进行什么级别的访问。访问许可权限的设置不但适用于本地计算机的用户,同样也应用于通过网络的共享文件夹对文件进行访问的网络用户。与FAT32文件系统下对文件夹或文件进行访问相比，安全性要高得多。另外,在采用NTFS格式的Win 2000中,应用审核策略可以对文件夹、文件以及活动目录对象进行审核，审核结果记录在安全日志中，通过安全日志就可以查看哪些组或用户对文件夹、文件或活动目录对象进行了什么级别的操作，从而发现系统可能面临的非法访问,通过采取相应的措施，将这种安全隐患减到最低。这些在FAT32文件系统下,是不能实现的。
·在Win 2000的NTFS文件系统下可以进行磁盘配额管理。磁盘配额就是管理员可以为用户所能使用的磁盘空间进行配额限制，每一用户只能使用最大配额范围内的磁盘空间。设置磁盘配额后，可以对每一个用户的磁盘使用情况进行跟踪和控制，通过监测可以标识出超过配额报警阈值和配额限制的用户，从而采取相应的措施。磁盘配额管理功能的提供，使得管理员可以方便合理地为用户分配存储资源，避免由于磁盘空间使用的失控可能造成的系统崩溃，提高了系统的安全性。
·NTFS使用一个“变更”日志来跟踪记录文件所发生的变更。
·还有诸如加密文件数据等等，和系统服务相关的东西不少。
NTFS的优点
1.具备错误预警的文件系统
在NTFS分区中，最开始的16个扇区是分区引导扇区，其中保存着分区引导代码，接着就是主文件表(Master File Table，以下简称MFT)，但如果它所在的磁盘扇区恰好出现损坏，NTFS文件系统会比较智能地将MFT换到硬盘的其他扇区，保证了文件系统的正常使用，也就是保证了Windows的正常运行。而以前的FAT16和FAT32的FAT(文件分配表)则只能固定在分区引导扇区的后面，一旦遇到扇区损坏，那么整个文件系统就要瘫痪。
但这种智能移动MFT的做法当然并非十全十美，如果分区引导代码中指向MFT的部分出现错误，那么NTFS文件系统便会不知道到哪里寻找MFT，从而会报告“磁盘没有格式化”这样的错误信息。为了避免这样的问题发生，分区引导代码中会包含一段校验程序，专门负责侦错。
2.文件读取速度更高效
恐怕很多人都听说NTFS文件系统在安全性方面有很多新功能，但你可否知道:NTFS在文件处理速度上也比FAT32大有提升呢?
对DOS略知一二的读者一定熟悉文件的各种属性:只读、隐藏、系统等。在NTFS文件系统中，这些属性都还存在，但有了很大不同。在这里，一切东西都是一种属性，就连文件内容也是一种属性。这些属性的列表不是固定的，可以随时增加，这也就是为什么你会在NTFS分区上看到文件有更多的属性.
NTFS文件系统中的文件属性可以分成两种:常驻属性和非常驻属性，常驻属性直接保存在MFT中，像文件名和相关时间信息(例如创建时间、修改时间等)永远属于常驻属性，非常驻属性则保存在MFT之外，但会使用一种复杂的索引方式来进行指示。如果文件或文件夹小于1500字节(其实我们的电脑中有相当多这样大小的文件或文件夹)，那么它们的所有属性，包括内容都会常驻在MFT中，而MFT是Windows一启动就会载入到内存中的，这样当你查看这些文件或文件夹时，其实它们的内容早已在缓存中了，自然大大提高了文件和文件夹的访问速度。
3.磁盘自我修复功能
NTFS利用一种“自我疗伤”的系统，可以对硬盘上的逻辑错误和物理错误进行自动侦测和修复。在FAT16和FAT32时代，我们需要借助Scandisk这个程序来标记磁盘上的坏扇区，但当发现错误时，数据往往已经被写在了坏的扇区上了，损失已经造成。
NTFS文件系统则不然，每次读写时，它都会检查扇区正确与否。当读取时发现错误，NTFS会报告这个错误;当向磁盘写文件时发现错误，NTFS将会十分智能地换一个完好位置存储数据，操作不会受到任何影响。在这两种情况下，NTFS都会在坏扇区上作标记，以防今后被使用。这种工作模式可以使磁盘错误可以较早地被发现，避免灾难性的事故发生。
有些人发现当把磁盘转换为NTFS文件系统后，用磁盘扫描程序就很难发现磁盘错误了。经过前面的介绍，你知道这是为什么了吗?
4.“防灾赈灾”的事件日志功能
在NTFS文件系统中，任何操作都可以被看成是一个“事件”。比如将一个文件从C盘复制到D盘，整个复制过程就是一个事件。事件日志一直监督着整个操作，当它在目标地——D盘发现了完整文件，就会记录下一个“已完成”的标记。假如复制中途断电，事件日志中就不会记录“已完成”，NTFS可以在来电后重新完成刚才的事件。事件日志的作用不在于它能挽回损失，而在于它监督所有事件，从而让系统永远知道完成了哪些任务，那些任务还没有完成，保证系统不会因为断电等突发事件发生紊乱，最大程度降低了破坏性。
5.我是否需要哪些附加的功能?
其实，NTFS还提供了磁盘压缩、数据加密、磁盘配额(在“我的电脑”中右击分区并并行“属性”，进入“配额”选项卡即可设置)、动态磁盘管理等功能，这些功能在很多报刊杂志上介绍的比较多了，这里不再详细介绍。
NTFS提供了为不同用户设置不同访问控制、隐私和安全管理功能。如果你的系统处于一个单机环境，比如家用电脑，那么这些功能对你意义不是很大。
NTFS使用注意事项
NTFS是微软Windows NT内核的系列操作系统支持的、一个特别为网络和磁盘配额、文件加密等管理安全特性设计的磁盘格式。除了在局域网安装了NT系列的用户们使用NTFS外，随着NT内核的桌面系统Windows2000和XP的普及，很多个人用户也开始把自己的分区格式化为NTFS。
在一般情况下，NTFS的格式不能被Windows9X识别，而且在安装、操作方面也有差异，所以个人用户在使用这种磁盘格式的时候，必须留意下面的注意事项：
一、NT内核的系统应始终使用NTFS 吗？
NTFS是微软推荐在NT系列上使用的文件系统，但是，会有一些特殊的原因使用其他文件系统。如果计划用其他操作系统（包括 MS-DOS）访问文件，则应把引导的分区，即C盘选择格式为 FAT（包括FAT32）文件系统。如果使用的是NTFS文件系统并要与Windows NT进行双重引导，那么在继续Windows 2000或XP的安装之前，必须要为Windows NT安装SP4或更高版本的补丁。
二、转化NTFS和其他分区格式的技巧
一台机器用PQ7把一个分区由NTFS转换成FAT32格式，完成后发现该盘中的中文名的文件夹全部变成问号，打不开了。此时想转回来时发现提示磁盘错误，用Windows的磁盘扫描和DOS的CHKDSK检查后仍无法转换，里面有其下载的几百M的文件，现在已经搞的面目全非了。
其实，如果NTFS的分区容量很大且内有大量的数据存在的话，用直接转换的方式不仅缓慢，而且是很危险的——因为在每一个步骤里，转换的工具程序都要先读取扇区信息、拷贝到临时目录、转化格式再从临时目录读数据重新写入转换好的空间，再校验……这样的操作其实和低级格式化硬盘或是刷新主板的BIOS差不多危险，一旦发生掉电或是瞬间的数据量过大传输溢出缓冲区导致的死机，重新开机后可能就会丢失分区的所有信息，或是破坏引导区数据甚至是损坏硬盘。
如果硬盘其他分区有足够的空间，用拷贝后删除文件再转化的方法，会事半功倍。具体的操作就是先在其他分区建立一个目录，然后转到你的NTFS分区，选定全部文件，用复制粘贴的方法进行转移数据。然后把NTFS分区的数据清空，再进行转化格式就快很多，也安全得多了；从FAT的格式转换到NTFS也是一样道理。这种拷贝，比直接转换分区格式读读写写、又校验数据的那种繁琐过程快很多，可以在转换完成后，把数据拷贝回该分区。
另外，建议在清空数据后，利用GHOST镜像NTFS或FAT格式的空白分区，得到一个备份文件，以后如果再要转换分区格式利用它来进行就更快。
三、虚拟内存（页面文件）与NTFS的卷
现在很多人装了双硬盘系统甚至是简单的RAID磁盘阵列，在使用这种结构的系统同时是需要NTFS支持卷功能的，此时，应该尽量避免页面文件和系统文件在同一分区上，也不要在同一物理磁盘驱动器的不同分区中放置多个页面文件。特别注意避免将页面文件放入容错驱动器，例如镜像卷或 RAID-5 卷，因为页面文件不需要容错，而且一些容错系统将数据写到多个位置，会导致非常缓慢的数据写操作。
四、如果使用了虚拟机或是磁盘压缩，不适宜使用NTFS格式
使用虚拟机时，在NTFS分区引导的机器上使用光盘引导后，在装操作系统的时候，将会出现以下提示：
Please wait while Setup initializes.
Scanning system registry...
Cannot create a temporary directory.
If you have HPFS or NTFS installed on your hard drive， you will need to create an MS-DOS boot partition to set up Windows.
因为虚拟机出于兼容的考虑，只内置了最常用的硬件和软件支持，对NTFS格式的支持目前还不是很好。如果你使用Windows9X加补丁的方式来读写NTFS分区的话，也可能会导致某些长文件名或是中文名的文件结构被破坏；在使用GHOST备份和恢复的时候也可能会出现莫名其妙的错误。所以，上NTFS还是用NT内核的系列视窗系统好。
另外，注意压缩过的分区不能转化为NTFS。其实压缩磁盘分区变相增大容量是以系统速度的极大牺牲为代价的；而且还会给以后的系统维护、转换分区格式、升级操作系统等等带来很大麻烦。除非是完全出于备份数据的考虑，其他的应用建议不要使用Windows的分区磁盘压缩功能。
温馨提示：内容为网友见解，仅供参考
第1个回答 2008-07-23
对于我这种游戏玩家来说^_^||| 唯一的不同就是NTFS的可以容纳4G的单个文件，而FAT32不行，所以还得分割.......很麻烦的，像什么鬼泣4的光盘镜像一个就要5G多~~
另外的就转啦：FAT分区与NTFS分区有什么区别？
NTFS
在选择 NTFS 时可以使用的功能有：
Active Directory，可用来方便地查看和控制网络资源。
域，它是 Active Directory 的一部分，在简化管理的同时，依然可以使用域来调整安全选项。域控制器需要 NTFS 文件系统。
文件加密，它极大地增强了安全性。
可以对单个文件设置权限，而不仅仅是对文件夹进行设置。
稀疏文件，这些是由应用程序创建的非常大的文件，以这种方式创建的文件只受磁盘空间的限制。也就是，NTFS 只为写入的文件部分分配磁盘空间。
远程存储，通过使可移动媒体（如磁带）更易访问，从而扩展了硬盘空间。
磁盘活动恢复记录，可帮助您在断电或发生其他系统问题时，尽快地还原信息。
磁盘配额，可用来监视和控制单个用户使用的磁盘空间量。
可更好地支持大驱动器，NTFS 支持的最大驱动容量比 FAT 支持的容量大得多，但随着驱动器容量得增大，NTFS 的性能并不随之降低，而 FAT 的性能却急速下降。
这只是最新版 NTFS 的部分功能列表。有关新功能的详细信息，请参阅 Windows 2000 Advanced Server 的新特性。
安装程序可以方便地将分区转换为新版的 NTFS，即使该分区以前使用的是 FAT 或 FAT32 文件系统，这种转换可保持文件的完整性（与格式化分区不同）。安装程序通过从检查现有的文件系统开始运行。如果文件系统是 NTFS，转换会自动发生。如果是 FAT 或 FAT32，安装程序可让您选择是否要将它们转换为 NTFS。如果不想保留文件，且有一个 FAT 或 FAT32 分区，建议使用 NTFS 格式化该分区，而不是转换 FAT 或 FAT32 文件系统。格式化分区会删除该分区上所有的数据，但使用 NTFS 格式化的分区与从 FAT 或 FAT32 转换来的分区相比，磁盘碎片较少，且性能更快。
但是使用 NTFS 依然有缺点，不论该分区是用 NTFS 格式化还是从以前的文件系统转换而来。在安装完成之后，也可以使用 Convert.exe 转换分区的文件系统。有关 Convert.exe 的详细信息，在结束安装之后，单击“开始”，再单击“运行”，键入 cmd 并按回车键键即可查阅它的信息。在命令窗口，键入 help convert，然后按回车键。FAT 和 FAT32
FAT 和 FAT32 是可选的文件系统选项。如果必须将计算机安装为有时使用以前的操作系统（有时使用 Windows 2000），则将要使用这些文件系统。其他信息，请参阅：
决定计算机是否包含多个操作系统
多个操作系统和文件系统的兼容性
包含 Windows NT 4.0 和 Windows 2000 Advanced Server 的计算机
在 NTFS、FAT 和 FAT32 间选择
有关 FAT 和 FAT32 之间区别的详细信息，请参阅在 NTFS、FAT 和 FAT32 间选择中的表格。如果要在 FAT 和 FAT32 之间做出选择，基本的标准是安装分区的大小。如果分区容量是 2 GB 或更大，应使用 FAT32 而不是 FAT 分区。
注意
Windows 2000 支持任意大小的由 Windows 95 或 Windows 98 创建的 AT32 卷。但是，Windows 2000 格式化的 FAT32 卷最大容量只能达到 32 GB。NTFS 是更好的选择，可应用在容量大于 32 GB 的卷上。
如果在安装过程中，选择使用 FAT 格式化分区，且该分区大于 2 GB，那么安装程序会自动用 FAT32 文件系统格式化。
在 NTFS、FAT 和 FAT32 间选择
可以为 Windows 2000 Advanced Server 计算机的磁盘分区选择下列之一的文件系统：NTFS、FAT 和 FAT32。NTFS 是推荐的文件系统。FAT 和 FAT32 彼此相似，但与 FAT 相比，FAT32 可用在容量较大的磁盘上。（最容易使用大磁盘的文件系统是 NTFS。）本节介绍的信息可帮助您比较这些文件系统，有关每种文件系统的其他信息，请参阅：
NTFS
FAT 和 FAT32
NTFS 与 FAT 和 FAT32 相比，它是最强大的文件系统。Windows 2000 Advanced Server 包括新版本的 NTFS，它支持各种新功能（包括 Active Directory），而域、用户帐户和其他重要的安全特性都需要 Active Directory 功能。
安装程序可以方便地将分区转换为新版的 NTFS，即使该分区以前使用的是 FAT 或 FAT32 文件系统，这种转换可保持文件的完整性（与格式化分区不同）。如果不想保留文件，且有一个 FAT 或 FAT32 分区，建议使用 NTFS 格式化该分区，而不是转换 FAT 或 FAT32 文件系统。格式化分区会删除该分区上所有的数据，但使用 NTFS 格式化的分区与从 FAT 或 FAT32 转换来的分区相比，磁盘碎片较少，且性能更快。
但是使用 NTFS 依然有缺点，不论该分区是用 NTFS 格式化还是从以前的文件系统转换而来。在安装完成之后，也可以使用 Convert.exe 转换分区的文件系统。有关 Convert.exe 的详细信息，在结束安装之后，单击“开始”，再单击“运行”，键入 cmd 并按回车键即可查阅它的信息。在命令窗口，键入 help convert，然后按回车键。
注意
只有通过选择 NTFS 作为您的文件系统，才能使用诸如 Active Directory 和基于域的安全性等重要功能。
有一种情况可能需要将 FAT 或 FAT32 选为您的文件系统。如果需要让计算机有时运行早期的操作系统，有时运行 Windows 2000，则需要将 FAT 或 FAT32 分区作为硬盘上的主（或启动）分区。这是因为早期的操作系统（只有一个例外），都无法访问使用最新版 NTFS 格式化的分区。例外是带有 Service Pack 4 或更高版本的 Windows NT 4.0，它可以访问使用最新版 NTFS 格式化的分区，但也有一些限制。Windows NT 4.0 无法访问那些用在 Windows NT 4.0 发布时，还没出现的 NTFS 功能存储的文件。详细信息，请参阅：
决定计算机是否包含多个操作系统
多个操作系统和文件系统的兼容性
但对于其他包含多个操作系统的情况，推荐的文件系统依然是 NTFS。
下面的表格介绍了每个文件系统与各种操作系统的兼容性。
NTFS FAT FAT32
运行 Windows 2000 的计算机可以访问 NTFS 分区上的文件。运行带有 Service Pack 4 或更高版本的 Windows NT 4.0计算机可能可以访问某些文件。其他操作系统则无法访问。 可以通过 MS-DOS、所有版本的 Windows、 Windows NT、 Windows 2000 和 OS/2 访问。 只能通过 Windows 95 OSR2、Windows 98 和 Windows 2000 访问。
下表比较了每个文件系统支持的磁盘和文件大小。
NTFS FAT FAT32
推荐最小的容量为 10 MB，
推荐实际最大的容量为 2 TB，并可支持更大的容量。
无法用在软盘上。
容量可从软盘大小到最大 4 GB。
不支持域。
容量从 512 MB 到 2 TB。
在 Windows 2000 中，可以格式化一个不超过 32 GB 的 FAT32 卷。
不支持域。
文件大小只受卷的容量限制。 最大文件大小为 2 GB。 最大文件大小为 4 GB
另外的就转啦：FAT分区与NTFS分区有什么区别？
NTFS
在选择 NTFS 时可以使用的功能有：
Active Directory，可用来方便地查看和控制网络资源。
域，它是 Active Directory 的一部分，在简化管理的同时，依然可以使用域来调整安全选项。域控制器需要 NTFS 文件系统。
文件加密，它极大地增强了安全性。
可以对单个文件设置权限，而不仅仅是对文件夹进行设置。
稀疏文件，这些是由应用程序创建的非常大的文件，以这种方式创建的文件只受磁盘空间的限制。也就是，NTFS 只为写入的文件部分分配磁盘空间。
远程存储，通过使可移动媒体（如磁带）更易访问，从而扩展了硬盘空间。
磁盘活动恢复记录，可帮助您在断电或发生其他系统问题时，尽快地还原信息。
磁盘配额，可用来监视和控制单个用户使用的磁盘空间量。
可更好地支持大驱动器，NTFS 支持的最大驱动容量比 FAT 支持的容量大得多，但随着驱动器容量得增大，NTFS 的性能并不随之降低，而 FAT 的性能却急速下降。
这只是最新版 NTFS 的部分功能列表。有关新功能的详细信息，请参阅 Windows 2000 Advanced Server 的新特性。
安装程序可以方便地将分区转换为新版的 NTFS，即使该分区以前使用的是 FAT 或 FAT32 文件系统，这种转换可保持文件的完整性（与格式化分区不同）。安装程序通过从检查现有的文件系统开始运行。如果文件系统是 NTFS，转换会自动发生。如果是 FAT 或 FAT32，安装程序可让您选择是否要将它们转换为 NTFS。如果不想保留文件，且有一个 FAT 或 FAT32 分区，建议使用 NTFS 格式化该分区，而不是转换 FAT 或 FAT32 文件系统。格式化分区会删除该分区上所有的数据，但使用 NTFS 格式化的分区与从 FAT 或 FAT32 转换来的分区相比，磁盘碎片较少，且性能更快。
但是使用 NTFS 依然有缺点，不论该分区是用 NTFS 格式化还是从以前的文件系统转换而来。在安装完成之后，也可以使用 Convert.exe 转换分区的文件系统。有关 Convert.exe 的详细信息，在结束安装之后，单击“开始”，再单击“运行”，键入 cmd 并按回车键键即可查阅它的信息。在命令窗口，键入 help convert，然后按回车键。FAT 和 FAT32
FAT 和 FAT32 是可选的文件系统选项。如果必须将计算机安装为有时使用以前的操作系统（有时使用 Windows 2000），则将要使用这些文件系统。其他信息，请参阅：
决定计算机是否包含多个操作系统
多个操作系统和文件系统的兼容性
包含 Windows NT 4.0 和 Windows 2000 Advanced Server 的计算机
在 NTFS、FAT 和 FAT32 间选择
有关 FAT 和 FAT32 之间区别的详细信息，请参阅在 NTFS、FAT 和 FAT32 间选择中的表格。如果要在 FAT 和 FAT32 之间做出选择，基本的标准是安装分区的大小。如果分区容量是 2 GB 或更大，应使用 FAT32 而不是 FAT 分区。
注意
Windows 2000 支持任意大小的由 Windows 95 或 Windows 98 创建的 AT32 卷。但是，Windows 2000 格式化的 FAT32 卷最大容量只能达到 32 GB。NTFS 是更好的选择，可应用在容量大于 32 GB 的卷上。
如果在安装过程中，选择使用 FAT 格式化分区，且该分区大于 2 GB，那么安装程序会自动用 FAT32 文件系统格式化。
在 NTFS、FAT 和 FAT32 间选择
可以为 Windows 2000 Advanced Server 计算机的磁盘分区选择下列之一的文件系统：NTFS、FAT 和 FAT32。NTFS 是推荐的文件系统。FAT 和 FAT32 彼此相似，但与 FAT 相比，FAT32 可用在容量较大的磁盘上。（最容易使用大磁盘的文件系统是 NTFS。）本节介绍的信息可帮助您比较这些文件系统，有关每种文件系统的其他信息，请参阅：
NTFS
FAT 和 FAT32
NTFS 与 FAT 和 FAT32 相比，它是最强大的文件系统。Windows 2000 Advanced Server 包括新版本的 NTFS，它支持各种新功能（包括 Active Directory），而域、用户帐户和其他重要的安全特性都需要 Active Directory 功能。
安装程序可以方便地将分区转换为新版的 NTFS，即使该分区以前使用的是 FAT 或 FAT32 文件系统，这种转换可保持文件的完整性（与格式化分区不同）。如果不想保留文件，且有一个 FAT 或 FAT32 分区，建议使用 NTFS 格式化该分区，而不是转换 FAT 或 FAT32 文件系统。格式化分区会删除该分区上所有的数据，但使用 NTFS 格式化的分区与从 FAT 或 FAT32 转换来的分区相比，磁盘碎片较少，且性能更快。
但是使用 NTFS 依然有缺点，不论该分区是用 NTFS 格式化还是从以前的文件系统转换而来。在安装完成之后，也可以使用 Convert.exe 转换分区的文件系统。有关 Convert.exe 的详细信息，在结束安装之后，单击“开始”，再单击“运行”，键入 cmd 并按回车键即可查阅它的信息。在命令窗口，键入 help convert，然后按回车键。
注意
只有通过选择 NTFS 作为您的文件系统，才能使用诸如 Active Directory 和基于域的安全性等重要功能。
有一种情况可能需要将 FAT 或 FAT32 选为您的文件系统。如果需要让计算机有时运行早期的操作系统，有时运行 Windows 2000，则需要将 FAT 或 FAT32 分区作为硬盘上的主（或启动）分区。这是因为早期的操作系统（只有一个例外），都无法访问使用最新版 NTFS 格式化的分区。例外是带有 Service Pack 4 或更高版本的 Windows NT 4.0，它可以访问使用最新版 NTFS 格式化的分区，但也有一些限制。Windows NT 4.0 无法访问那些用在 Windows NT 4.0 发布时，还没出现的 NTFS 功能存储的文件。详细信息，请参阅：
决定计算机是否包含多个操作系统
多个操作系统和文件系统的兼容性
但对于其他包含多个操作系统的情况，推荐的文件系统依然是 NTFS。
下面的表格介绍了每个文件系统与各种操作系统的兼容性。
NTFS FAT FAT32
运行 Windows 2000 的计算机可以访问 NTFS 分区上的文件。运行带有 Service Pack 4 或更高版本的 Windows NT 4.0计算机可能可以访问某些文件。其他操作系统则无法访问。 可以通过 MS-DOS、所有版本的 Windows、 Windows NT、 Windows 2000 和 OS/2 访问。 只能通过 Windows 95 OSR2、Windows 98 和 Windows 2000 访问。
下表比较了每个文件系统支持的磁盘和文件大小。
NTFS FAT FAT32
推荐最小的容量为 10 MB，
推荐实际最大的容量为 2 TB，并可支持更大的容量。
无法用在软盘上。
容量可从软盘大小到最大 4 GB。
不支持域。
容量从 512 MB 到 2 TB。
在 Windows 2000 中，可以格式化一个不超过 32 GB 的 FAT32 卷。
不支持域。
文件大小只受卷的容量限制。 最大文件大小为 2 GB。 最大文件大小为 4 GB
参考资料：反正是引用的就是....
第2个回答 2008-07-23
都可以用作系统盘，FAT32速度快，稳定性不好，另一个刚好反的，但多半就用FAT32当系统盘…因为稳定性也不是很差，只是相对的。
第3个回答 2008-07-23
那是因为NTFS与FAT32格式的簇大小不一样造成的，而且NTFS格式存储文件的效率更高，所以没有必要在乎那么一点空间，今后存储文件还是NTFS格式的好。本回答被提问者采纳
第4个回答 2008-07-23
相当于2000和xp的差别,更安全更高效
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