在公司旷工离职对档案有什么影响

我目前是在国企工作，由于公司各部门有辞职人数上限的规定，今年不能给我批辞职报告，新的公司要求我下周二报道，现在只能通过旷工被开除的方式解除劳动关系，咨询了公司人力部，这样要写入档案，对于我后期影响大吗？我的新公司是一家事业单位。