结局：苗族已长期饱受旱灾之苦，民不聊生，黑白二苗之间彼此争战不休。痊愈后的灵儿来到女娲神庙，施法用五颗灵珠召唤来雨水，终于解除苗疆的旱灾，族人全部欢喜庆祝。这时突然出现魔兽，三人击倒后顺着魔兽留下的地道来到南诏王宫，确认这一切又是拜月教主挑拨离间黑白苗两族的计划。
众人奋力击败拜月教主，此时拜月教主却跳入水中解除封印与水魔兽合二为一，遇水不死(旧版只需击倒拜月教主，新版则需再多击倒一次拜月教主与水魔兽的合体)。为拯救苍生，灵儿最终决定和巫后一样，牺牲自己与拜月教主同归于尽，完成女娲世代守护人民的宿命。
灵儿过世后，伤心欲绝的李逍遥于是动身离开苗疆，一旁阿奴只能哀伤地奏笛送流水无情的逍遥逐渐远去。在大雪纷飞之中，却见到远方林月如抱着李忆如在树下等候…..故事完。
扩展资料：
仙剑奇侠传采用分支结局制，除了原本结局，亦有以下增补剧情：
1、林月如结局
八年后，李逍遥继任蜀山仙剑派掌门，一日，回到苏州林家堡探亲，李忆如却被不知名的侠盗绑走，李逍遥随后追到隐龙窟，才发现两名侠盗是李忆如与丫鬟所假扮，李逍遥欲将李忆如追回且教训，不料遇见八年前在扬州被李逍遥击败而入狱八年的女飞贼姬三娘;
后来才发现，因李逍遥忙于教导仙剑派弟子，半年没回林家探亲，误以为李逍遥忘了林月如和李忆如，林月如一气之下，假扮姬三娘，计划恶整李逍遥，最后在复杂中和解，并且要实现当年在长安尚书府时立下的承诺：一切安顿好后，两人要看遍天下山水、吃遍天下珍味。李逍遥、林月如、李忆如一干人等，立誓三人永不分离。
2、赵灵儿结局
八年后，赵灵儿还活着，李大娘将客栈交给张四，与李逍遥、赵灵儿、李忆如移居仙灵岛。一日，李忆如和小草妖玩捉迷藏玩过头，差点被李大娘大骂一场，李逍遥出门寻找李忆如，走到桥边时看到灵儿回忆着往昔，不禁感慨万千，逍遥说只愿永远和灵儿厮守在一起。后来淘气的忆如回来，父女俩斗嘴，灵儿劝。回水月宫后李忆如从房间拿出自己画的全家福画给爹娘欣赏，画里还多画出了不知道是阿奴还是巫后。
如果是画面精美，有1.8G之巨的新仙剑奇侠传是，则有三个结局
在老仙剑（DOS/95/98版）中，只有一个悲伤的结局，让广大玩家叹息，于是在2001年推出的新仙剑中，除了正常结局之外，还增加了两个隐藏结局，如果玩家能满足特定条件，将有可能触发灵儿复活或月如复活的结局。
附：游戏的结局：
一、DOS/98版结局:
拜月被打败后强行与水魔兽合体,造成南绍国洪水泛滥,灵儿履行她女娲族的使命,印封拜月,与之同归于尽.在落日的余辉映照,天蛇杖缓缓落下。
一番悲痛之后，逍遥辞别阿奴，踏上返乡之路，阿奴黯然神伤地吹笛为他送行。
风雪茫茫，逍遥举步为艰，迷茫间，远远看见雪中的一棵大树下，一个熟悉的身影在默默守候，(镜头拉近)原来是月如(这应该是圣姑所要的那36只傀儡虫的作用了)手撑一伞，怀抱忆如，正深情地望着逍遥。逍遥大步赶了上去……
二、新仙剑/XP版
大致与98版相同，不过在看结局之间还要在水下迷宫中找到拜月与水魔兽的合体怪兽，将其干掉后，灵儿伤口迸裂，垂死的拜月吸取灵儿流出的女娲血后，得到了不死之身，灵儿用旋风咒将逍遥和阿奴送出水面，自己则与拜月同归于尽(从这里起与98版完全相同，当然动画更美观，故情节省去)
1)标准结局：一段制作人员列表过后，镜头回到盛渔村(逍遥的家乡)，又回到了盛鱼村，玩家操纵王小虎。王小虎来到市集的木匠店，一名蛮不讲理的客人要求换椅子，学徒小贵子请求小虎请正在修篱笆的师父回店。小虎来到十里坡下的篱笆前，把事情告诉夫木匠师傅，木匠师傅便匆匆离去。王小虎来到十里坡顶，看见李逍遥正要跳到对面的山崖，秀兰在一旁劝住。李逍遥一下子跳了过去……十四年后，王小虎已长成身强力壮的青年了，在两个山崖中搭了一个桥，又是个风卷云残，预告仙剑2代剧情……
二)月如版隐藏结局：
在水下迷宫中找到拜月与水魔兽的合体怪兽，将其干掉后，灵儿伤口迸裂，垂死的拜月吸取灵儿流出的女娲血后，得到了不死之身，灵儿用旋风咒将逍遥和阿奴送出水面，自己则与拜月同归于尽。在落日的余辉映照,天蛇杖缓缓落下。
一番悲痛之后，逍遥辞别阿奴，踏上返乡之路，阿奴黯然神伤地吹笛为他送行。
风雪茫茫，逍遥举步为艰，迷茫间，远远看见雪中的一棵大树下，一个熟悉的身影在默默守候，(镜头拉近)原来是月如(这应该是圣姑所要的那36只傀儡虫的作用了)手撑一伞，怀抱忆如，正深情地望着逍遥。逍遥大步赶了上去……
一段制作人员列表过后，时间切换到8年后，身为蜀山代理掌门的逍遥处理完事务后回到林家堡，刚与林忠对话不到两句，后院传来尖叫之声，得知忆如被人绑架，一路追踪到隐龙窟大殿(沿途可发现散落的忆如衣物)，遇到“宝家林双侠”，与其中的小飞贼对战(不须打，只要防守几个回合即可)，却发现竟是忆如在胡闹，正要教训忆如，姬三娘(不要说忘了她是谁)神秘出现，与之力战(必须战胜)，却发现她使出了“斩龙诀”，追问，月如这才露出真容，一家人喜笑颜开 ……
三）灵儿版隐藏结局：
在剧情中灵儿还是会和拜月同归于尽，不过在天蛇杖落下之时，镜头慢慢地切换成了逍遥和灵儿深情对望………
一段制作人员列表过后，时间切换到8年后，仙灵岛上，忆如与六个小妖玩捉迷藏的游戏(其中有个叫阿皮的比较难找，须沿进岛方向在下方有树一侧慢慢调查)，找完后，李大娘来叫忆如回去吃饭，半路上忆如又去抓蝴蝶。逍遥只得亲自去找忆如，在水月宫外遇到灵儿，共忆往事，这时，忆如也回来了……本回答被提问者采纳
新仙剑与其他几版的不同之处在于多了两个隐藏结局。一个月入结局，一个灵儿结局。
