我12月份辞职了，1月份旷工超过了3天，厂里说要罚款和扣我半个月的工资，会不会扣到我上个月的工资去.....

当然不会啦，不过这要看你们厂领导如何处理了。

1、旷工是你不对，公司如果员工手册上有相关规定，按照公司的规章制度处理。
2、虽然你递交了辞职信，有一个月的交接期，但是这个期间并不是说你已经自由了，而是继续受公司规章制度约束的。该请假的，要办理请假手续，如果未办理请假，按照公司规定的旷工违规处理。
3、你旷工的3天不光没有工资，而且还需要罚款。
个人觉得，在这件事上是你自己处理欠小心。劳动法虽然在于保护劳动者，但也并不是让劳动者可以无视公司的规章制度。