毕业档案的问题。有经验的朋友请帮我解决一下~谢谢了

我是应届毕业生，学校1月份急着让我们签了就业协议。当时就随便找了熟人的公司盖了章给交过去了~
我现在就担心一般毕业时候是学校把档案交到我们自己手上还是直接转去我签了协议的那家公司呢？
如果我不想档案转过去协议上的公司该怎么做呢？
然后档案是放在人才市场还是另外有什么好的地方存档呢？
谢谢~