哈哈，这个问题如果按正常的思路去分析，那根本无从着手，两千多年前的事，就连史记的记载也是矛盾的，我们不妨换个角度，假如这是真的，秦始皇的生父是吕不韦这个消息是怎么传出来的？
根据史记的记载，最初知道这件事的只能是三个人，亲爹，绿帽爹，亲娘，我们一个一个的分析。
亲爹吕不韦，他会跟别人说吗？嫪毐酒后说自己是秦始皇的假夫，传到秦始皇耳朵里，秦始皇立马把他灭了，而史记中没有记载吕不韦跟别人说这件事，如果有酒后失言，史记一定会记载，然而没有。
绿帽爹庄襄王，如果他知道秦始皇不是他儿子，还会立他为太子吗？显然他不知道这件事。
亲娘赵姬，孩子的爹是谁，毫无疑问亲娘是最知道真相的，然而她会去跟别人说吗？如果说了，她和她儿子的地位就危险了，只怕要死无葬身之地，她没有任何理由去说，除非脑袋坏掉了。
这就很奇怪了，史记中记载了这件事却没有记载出处，而事件的当事人亲爹没有跟人说，亲娘没有跟人说，绿帽爹不知道这件事，这不是很奇怪吗？
结论：都是反秦的六国后裔故意抹黑秦始皇罢了。
大家为什么一直对秦始皇的身世争论不休呢？叫他吕政或者赵政都代表着一种实力竞争要是叫赵政就是秦灭掉六国，叫吕政那就是六国灭秦了因为他国君的血统都是非嬴氏的。而且六国的人对秦始皇恨之入骨，要是能够在他身世上做点文章就太解气了，况且老百姓最喜欢这种八卦娱乐新闻一传十十传百全天下人就都知道了。最后最无奈的一种方法就是开馆验尸，按照DNA比照就真相大白了其实完全没有必要，按照现代医学历史事迹证明秦始皇父亲就是赢异人正宗的嬴氏继承人。
吕不韦，战国末卫国濮阳人。原为大商人，在赵都邯郸遇见入质于赵的秦公子异人，认为“奇货可居”，因入秦游说华阳夫人，立异人为太子。秦庄襄王继位，任为相国，封文信侯。秦庄襄王卒，秦王政年幼继位，继任相国，称为“仲父”。嬴政十三岁，即位为秦王。
虽然吕不韦是一个非常成功的商人，但他深感商人社会地位太低，在乱世争霸的年代，赵国与秦国相比，赵国太弱小，他萌发了去秦国从政的雄心。吕不韦深谋远虑，利用秦国人质嬴异人，布署进入秦国的计划。
赵姬乃邯郸一名妓，她生得沉鱼落雁，楚楚动人。吕不韦不惜重资买来为妾。过了几个月，赵姬怀了孕。吕不韦告诉赵姬说：“我打算谋取秦国，因此娶你，待你有娠，进献给异人。异人现在赵为质，没有妻子。如果生子是男，异人必会立为嗣子，异人过世后，此子必然登基，你我夫妇凭此而取秦之天下！”
第二种说法：秦庄襄王
嬴政生于秦昭王四十八年。秦昭王是嬴政的曾祖父，中间还隔着祖父秦孝文王和父亲秦庄襄王即子楚。子楚当时还只是秦昭王众多孙子中被抛弃的一个，几乎没有可能继承王位，吕不韦把宝押在他身上已是匪夷所思，更何况是子楚的继承者？孝文王和庄襄王碰巧都很短命，一个只在位一年，一个只在位三年，嬴政才因此早早登上了王位。吕不韦如果能预见这种巧合，那可真是神仙了。
从科学的角度看，说吕不韦是秦始皇的生父，问题更大了。很显然，嬴政是在赵姬嫁给子楚一年以后出生的，后人为了把嬴政说成吕不韦的儿子，才有怀孕12个月这种离奇的传说。人类妊娠时间从受孕之日算起平均不足9个月，仅为266天。古人因为不知道女性的受孕时间，有了“怀胎十月”这种不准确的说法。如果真的怀胎十月，对胎儿是相当危险的，更不要说怀胎12个月了。
根据医学常识我们可以断定秦始皇不可能是吕不韦的儿子。虽然有关吕不韦是秦始皇的生父的说法不见于《战国策》等其他史料，是《史记》首先提出来的，但是现在的历史学家之所以不敢否定甚至去肯定这种说法，是因为相信司马迁，以为太史公不会胡写。
嬴子楚：即秦庄襄王(前281年－前247年)，又称秦庄王，嬴姓赵氏，本名异人，后改名为楚，故又称“嬴楚”，或简称“子楚”。是秦始皇帝嬴政的父亲。
异人曾在年轻时作为人质居住于赵国都城邯郸，因为秦国屡次攻赵，他的处境很困难。这时，有个卫国大商人吕不韦知道了他的情况，认为他是“奇货可居”，决定进行一次政治赌博，于是，设法结识了他，成为密友。吕不韦用重金买通了太子安国君(秦孝文王)宠爱的华阳夫人，使她劝说安国君立子异人为嫡嗣。为了博得出生于楚国的华阳夫人的欢心，子异人在吕不韦的授意下，改名为楚。公元前250年，秦孝文王继位三天后突然暴薨，子楚继位。
秦始皇的母亲是赵姬，《秦始皇本纪》和《吕不韦列传》里的记录有分歧，嬴政的父亲究竟是异人还是吕不韦，在正史野史中的争论仍在继续。
秦始皇帝者，秦庄襄王子也。庄襄王为秦质子於赵，见吕不韦姬，悦而取之，
生始皇。以秦昭王四十八年正月生於邯郸。及生，名为政，姓赵氏。年十三岁，
庄襄王死，政代立为秦王。-----《秦始皇本纪》
2、吕不韦
在《史记·吕不韦列传》中，司马迁再着笔墨：“姬自匿有身，至大期时，生子政。”
（注：司马迁《史记》的这两个文献都明确记载了异人娶的是吕不韦的爱妾赵姬，赵姬生了始皇。至于赵姬被异人娶回家中之时是否怀孕，《秦始皇本纪》无载，而《吕不韦列传》则明确记载。）
3赵括
在黄易的《寻秦记》中，嬴政是赵盘冒名顶替的，其母赵雅，赵王之妹，赵括之妻。本回答被网友采纳
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