双硬盘双系统，如何选择启动盘？

硬盘为串口的，主板P5Q SE PLUS。
先只接第一块硬盘，安装系统；再只接第二快硬盘，安装系统。（认为这样装开机会出错的请离开，谢谢关注。）
最后把两块硬盘都接上去，如何不插拔接线选择需要启动系统的硬盘？
给个详细步骤，谢谢。