是的，这就是电影的结局。
先知随着对人类的研究逐渐理解并拥有了人类的情感，这是与同为程序的架构师最大的不同，先知想要终结机器与人类的战争并因此创造出了尼奥和史密斯。
最终一战尼奥与史密斯融合分解了，架构师也履行对尼奥的承诺允许那1%的人类永久的生存在锡安中，先知的矩阵革命得以实现。最终先知和尼奥共同拯救了人类。
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尼奥和史密斯都是先知创造的，用来和构架师谈判的筹码：
尼奥的选择终结了矩阵升级锡安毁灭重建的循环，但却迎来了另一个问题，如果尼奥不进入代码之源，那么架构师就会亲自毁灭人类。
先知为此改造了“特工”史密斯使之成为一个类似病毒的非法程序存在，这点从先知和尼奥的对话中可以得知只有先知知道史密斯和其他特工程序的不同，史密斯是尼奥的对立面。并且只有尼奥能打败史密斯来阻止史密斯复制自己毁灭世界。
在第一部史密斯和被抓住的莫菲斯的对话中，史密斯试图离开矩阵的强烈意图就已经体现了史密斯与其他特工程序的不同。史密斯原本不属于非法程序，也不可能是架构师改造用来毁灭自己的机器世界的，所以有理由相信是先知一手将史密斯改造成了非法程序，用来作为尼奥与架构师最终谈判的砝码。
暂时和平，人类作为奴隶的结局永远不会改变，因为机器人的智商已经超过人类了。但是，机器人程序是经常有病毒出现的，等下一个病毒出现的时候，又会出现新的尼奥，来帮忙机器完善自身的程序。人类，依然是奴隶。
机械主也因此获得了史密斯的代码，从而成功将其清除，在最后一刻拯救了仅存的人类，还有被机器大军破坏殆尽的锡安城，机器世界与真实世界都获得了和平，人类从此可以选择生活在矩阵或现实世界，而造物主也承诺不愿生活在机器世界（母体）的人类将会获得自由。在最后，先知表示相信b166er还会回来。（剧终）
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角色介绍——
1、b166er
b166er是动画片《The Animatrix》（黑客帝国动画版）中出场的一个机器人角色。该角色因为拒绝被主人停机而杀死了他的主人，而在被为此裁决销毁之前他抗辩道自己的行为是正当防卫，这一事件后来掀起了一场机器人与人类之间、人类与人类之间的大争论，进而发展成了第一次人机战争。
2、Osiris
这架舰艇在电影第二集重装上阵中的开头曾被提及。由于发现机器人开始使用巨钻进攻锡安而被机器人发现攻击，最终通过矩阵将信息转达给锡安和尼奥等人，但自己最终被机器人围歼自爆牺牲。
本回答被网友采纳。。。那样有什么意义。。。还不是有一大堆人要被当作电池来用嘛。。。还有一大堆人生活在母体里啊。。。而且在Zion的人类都还是要被机器人所限制啊。。
追答不是不是 尼奥在机器人大面积攻击人类以后还要回去打史密斯就是因为机器人的请求 不然他也没机会再回去，而且他也不必再去打史密斯 因为史密斯已经是病毒了 不受机器人们管理；史密斯的存在威胁到了人工智能的存在 所以机器人跟尼奥定了约定 尼奥如果赢了史密斯 机器人就撤走并放弃控制人类；结果尼奥赢了 所以机器人最后全部撤走了。电影中机器人撤走的场面挺壮观的啊你怎么没注意到呀
本回答被提问者采纳《黑客帝国》结局人类还是输了吗
《黑客帝国》结局人类还是输了，虽然结局是暂时和平，但是机器已经全面超越人类，已经改变不了人类成为机器奴隶的命运。结局是母体利用尼奥诱骗史密斯侵入尼奥的身体，将母体中最大的BUG消灭了。而尼奥为了拯救现实中的人类，利用这样的机会与母体达成协议，牺牲自己帮助母体消灭史密斯。史密斯虽然被消灭的，但是...
《黑客帝国》结局人类还是输了吗?
《黑客帝国》的结局不是输了。结局是：尼奥和史密斯双双被机器删除,机器撤回电子乌贼大军,人类迎来了和平。还有一种对结局背后的推测是：实际还是人类输了。就是母体为了进化，用人类作为能源，在进化的过程中有一些不肯被删除的程序（比如人类）想逃出母体。还有一些失去控制的程序，比如史密斯，也有一些想...
黑客帝国动画片,最后的一段,有看懂的没
结局：b166er进入机器城市后，与身为机器首脑的机械主（其地位相当于诺斯底主义中的上帝，详见“缓和二元论”处）达成停战协议。而代价是b166er必须进入矩阵，删除叛逃异变的强大病毒——史密斯。经过一番苦战之后，b166er败了，被史密斯所感染复制，但是机械主也因此获得了史密斯的代码，从而成功将其清除，...
黑客帝国3最后大结局到底怎么了?看不懂,史密斯怎么一下全死光了
结局：尼奥和史密斯全都死了，而整个系统也彻底崩溃了，只能让设计师重新开发新的系统。原因：史密斯感染了作为诱饵的尼奥，使机器大帝掌握了删除史密斯和尼奥的办法，最后以尼奥为进入矩阵的通道注入了大量的删除代码，导致尼奥的大脑被烧毁直接死亡，而史密斯及其复制品也在源源不断的删除代码中得以删除。
《黑客帝国》三大结局解析是什么?
《黑客帝国》三大结局解析如下：对话揭示了机器人已经不仅仅再是没有情感的程序，这一家人和先知一样已经理解了什么是爱，就是愿意为对方付出一切。所以即便这位父亲知道当矩阵完成升级后自己也将会成为非法程序被删除，他却没有和其他非法程序一样选择逃避，而是和妻子尽可能地保住自己的女儿。所以被注入了...
黑客帝国的结局是什么意思?
黑客帝国的结局，就是母体、史密斯、尼奥全部系统崩溃被删除。史密斯在剧情中，类似一个叛逆的程序，就像病毒一样可以无限复制，母体无法对其进行控制。就像我们的电脑系统，无法独立直接删除病毒一样。而在大结局中，尼奥和史密斯中和，成为母体可控的程序，同时利用删除程序将母体和自身全部删除。
黑客帝国到底是说什么啊
这一站不但关系人类最后一个基地内居民的性命，更关系到人类本身的存亡。然而抵抗军内部早埋下不安定的因素，即被史密斯探员(雨果-维文饰)所侵入的本(伊安-布里斯饰)。变得更加强大的史密斯探员，连矩阵也无法掌控，他的存在同时威胁到真实世界与矩阵双方的存在。先知(玛丽-艾丽丝饰)给了尼奥最后的指引，...
《黑客帝国3》结局是什么?
结局：尼奥和史密斯全都死了，而整个系统也彻底崩溃了，只能让设计师重新开发新的系统。原因：史密斯感染了作为诱饵的尼奥，使机器大帝掌握了删除史密斯和尼奥的办法，最后以尼奥为进入矩阵的通道注入了大量的删除代码，导致尼奥的大脑被烧毁直接死亡，而史密斯及其复制品也在源源不断的删除代码中得以删除。《...
谁看懂黑客帝国了?
当史密斯完成了对尼奥的入侵,湮灭就这样到来了,光芒中,两个世界都恢复了平静,机器和人类的共生终于获得了和平。 如果仅仅把《黑客帝国》系列当作特技和神话,难免偏颇,这个故事必须是这样的结局,没有巧合和戏剧,因为“勺子本不存在”,这个故事其实写的是人类的真实历史,而不是好莱坞似的不能实现的梦想。从自然科学的...
《黑客帝国3》结局解析是什么?
《黑客帝国3》结局解析如下：《黑客帝国3》以主要人物尼奥、史密斯双双衰亡，整个系统崩溃为结局。结局中史密斯感染了尼奥设下的病毒，机器大帝因此掌握了删除史密斯和尼奥方法，最后尼奥进入矩阵注入了大量的删除代码，导致尼奥的大脑直接被烧毁，而史密斯也被删除代码删除。这意味着电子世界遭受全方位的湮灭与...
