根据银行贷款归还条例，银行贷款第一次还款提醒余额不足的话银行会进行第二次扣款的，只要你代扣的银行卡里有足够的资金，银行就会自动代扣贷款。
银行贷款需要用银行卡代扣进行还款。银行贷款是指银行根据国家政策以一定的利率将资金贷放给资金需要者，并约定期限归还的一种经济行为。一般要求提供担保、房屋抵押、或者收入证明、个人征信良好才可以申请。
扩展资料：
贷款可以提前进行还款。提前还款是借款人支付的超过每月还本付息金额的部分。没有全部清偿抵押贷款的提前还款称为部分提前款。通过合同安排,禁止在约定期间内提前还款，该约定期间称为锁定期。锁定期为2—10年不等。锁定期之后，提前还款的保护通常采取其他方式，如提前还款罚金点数或收益率维持费。
参考资料：
有两种情况：
如果是住房公积金贷款，当日扣款没有全额扣款，又另外存款后，只能等到下月扣款日才能把未扣完款项扣全，住房公积金贷款手动操作扣款，不是批量扣款。一次迟还不影响信用。
如果是银行按揭贷款，第二天就会把欠款扣完了。偶尔一次迟还一天不会影响信用。银行房贷扣款属于批量扣款，还款人应该尽量在扣款日17点之前把款存入账户。
银行批量扣款时如果贷款人还款账户款项不足，未完全扣款，会在扣款日的次日起，每一天批量对未还款账户操作一遍扣款程序，所以，你当晚存的款项如果没有及时扣款（晚上九点的确晚了）会在第二天扣完。
建议还款人在扣款日前按还款协议把款项存入还款账户，如条件方便，可在还款日查询一下账户余额是否足够房贷扣款。以免延迟扣款后产生滞纳金并影响个人信用。
我贷款的时候设置的是自动还款。到还款日当天，账户余额不足，还款失败。之后我再打钱进入贷款关联银行卡，几分钟后自动还款完成。所以如果余额不足，贷款时所使用的银行卡会一直扣款的，直到还完当期所欠金额。
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该情况会二次扣款。根据《中华人民共和国中国人民银行法》规定，房贷扣款账户余额不足，银行会在当月的扣款日进行首次扣款尝试，该次扣款未能成功，银行会在随后的一到几个工作日内再次尝试扣款。第二次扣款仍然失败，银行会发送短信或电话通知及时还款，避免逾期产生不良记录。
