请问公司对休息日的出勤规定只能调休，且超过半年未调休的部分自动作

关于公司调休是否合法的问题，依据《中华人民共和国劳动法》规定，公司可以根据工作需要，休息日安排劳动者工作并安排好补休。
如果休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，应当支付不低于工资的百分之二百的工资报酬。
下面是法律规定。
《中华人民共和国劳动法》
第四十四条 有下列情形之一的，用人单位应当按照下列标准支付高于劳动者正常工作时间工资的工资报酬：本回答被网友采纳

如果公司实行的是无固定时间工作制就是合法的如果公司实行固定工作时间则是不合法的可以到当地劳动保障局投诉公司让政府制止公司的违法行为维护你的合法权益