Java编译运行正常，但做成Jar就运行不了

本人是VB.Net和单片机C语言高手~不是编程初学者，迫于第三方提供的库是jar，才不得以研究了一下Java，成为Java初学者，现在程序用eclipse写出来了，编译运行都正常，打包jar过程也正常，但是打包出来的jar运行就不正常，选择不同的打包方式，捕捉到的错误还不一样：
1、如果选择“Package required libraries into generated JAR”（就是全部文件打成一个包），报错的时候有一句“URI is not hierarchical“；
2、如果选择“Copy required libraries into a sub-folder next to the generated JAR”（就是引用的文件独立放在一个文件夹中），则说找不到路径“C：\\bin”。
还有另一个选项，提示有licence问题，这个就不说了。
从报错的内容和地方看，明显是第三方的jar抛出来的，所以网上说的什么“流方式读取资源“那些根本没用，我不可能去改人家的代码，人家是大名鼎鼎的公司，jar应该也没有问题。
于是我又试图放弃打包jar的方法，选择命令行执行class，但是在编译好的class路径下运行，或者把所有class放到前面第二点说的jar包独立文件中运行（class和所有引用到的jar都在一起了），又都提示“java.lang.NoClassDefFoundError”，就是第三方的文件没找到。另外，我的项目用到Swing，swing的东西在控制台上能不能启动呢？
我现在的想法是，不管jar包也好，控制台也好，只要能脱离eclipse环境即可，我的代码加上引用全部打包也才30M，不可能要所有人都装个几百M的eclipse，而且eclipse还很占内存。
请java高手赐教！

补充说明，上面说的第三方jar是TI公司提供的，作为上位机用于烧录单片机，本身单片机这些东西就很冷门，TI的单片机更加高冷，网上基本找不到，官方全是艰涩不全的英文资料，如果有同行感兴趣，也可以奉上我的代码一起交流。

你选择你的工程打包是不是右键工程->Export,然后选择上面圈出来的。

是

你能把代码发我，我帮你打包看看可否？

谢谢！搞到现在终于解决了，好多坑！代码给你也运行不了，第三方软件是个2G庞然大物，太麻烦了。
这个问题应该是这样的，eclipse里面对第三方jar是绝对路径引用，但是打包之后，第三方jar就被复制出来，相当迁移了路径。而那个jar里面肯定是用了相对路径，所以一旦迁移了jar，就找不到他要的路径了。还有一些是因为对命令行和环境变量不熟悉引起的，所以问题更多。
您那么热心要帮我看代码，分就送给你吧！

嗯，谢谢了，解决了就好，你真厉害！