加班工资怎么算？

我是某公司职员，我们公司的工资制度让我觉得有点疑问，因为我们经常会出现加班或者请假，我们公司的公司制度是：
加班一天工资=基本工资/满勤天数；请假一天扣工资=全工资/满勤天数。
我们公司的工资组成是：基本工资+岗位工资，以我的工资为例：我的工资是4000元，基本工资1000元+岗位工资2500元+通讯补助200元+工龄工资300元=4000元。

如果当月满勤天数为25天，该月我请假一天，则我请假一天公司要扣我工资为 3500元/25天=140元（一般公司不将通讯补助及工龄工资计算在内），也就是说我请假一天要扣我140元工资；如果我加班一天公司则按基本工资1000元/25天=40元，这也就是说我加班一天只能有40元。如果我十月一日加班一天，按照我想的应该是有140元*3倍=420元，但是按照我们公司的制度我只能拿到140元+40元+40元=220元，这个正常吗？我个人认为这个是公司和我们玩的文字游戏，而且有一次我专门问了公司的财务总监，为什么我加班一天一共才40块钱，请假一天就要扣140块钱，我加班一天还不如我上正常班一天的工资。财务总监告诉我法律规定加班工资是按基本工资除以满勤天数计算的~我就纳闷了~
因为我的工作一直比较忙，而且长期出差，我们公司对于我这样长期出差经常加班的员工基本上都是以调休、轮休来顶加班的，这个倒是符合相关法规的要求，我从去年十月一日开始到现在已经一年零一个月了，我个人累积了大概40多天左右的轮休，也就是说这一年我除了过年休息了，其他周日，五一、十一等等假期基本上很少休息，前段时间回到公司因为要疼得厉害，和老总请假，老总干脆的回绝到，忙的不能请假，按照正常法律规定如果我要求轮休以上天数或者要求将以上天数按劳动法相关规定发成工资是否合理？