公安交通管理部门和车辆管理所在其级别和具体责任划分是有区别的，他们的区别为：
1、行政级别不同。公安交通管理部门是道路交通安全管理的职能部门，也是车辆管理所的上级管理部门；而车辆管理所是公安交管部门的下属部门。
2、管理权限不同。公安交通管理部门可以对交通违法行为进行处罚；而车辆管理所是不能对交通违法行为进行处罚的。
3、管理内容不同。公安交通管理部门管理内容包括指挥疏导路面交通，实行道路交通管制；管理和规范交通秩序，纠正处罚交通违法行为；参与规划、设计城市交通设施建设；办理各种机动车通行证件。而车辆管理所只能对车辆的相关信息进行管控。
参考资料来源：百度百科——车辆管理所
参考资料来源：百度百科——北京市公安局公安交通管理局
两者所属部门不同，管辖区域不同，职责不同。
一·部门不同：公安交通管理部门是各级公安机关主管道路交通安全的职能部门。
车辆管理所是一个公安系统的直属机构。
二·管辖区域不同：车辆管理所一般县级或县级以上行政区域才有。
公安交通管理部门是一个组织、指导和监督地方公安机关依法查处道路交通违法行为和交通事故的国家机关。
三·职责不同：
公安部交通管理局主要职责：
（一）拟订道路交通管理的政策、规定。
（二）指导、监督地方公安机关依法查处道路交通违法行为。
（三）指导地方公安机关实施对剧毒化学品的道路运输审批。
（四）指导、监督机动车（不含拖拉机）登记、安全检验和驾驶人考试发证工作。
（五）组织、指导道路交通安全宣传教育工作。
（六）组织、指导道路交通管理科技工作。
（七）指导地方公安机关组织城市道路交通。
（八）主管公安部交通管理科学研究所（中国道路交通管理干部培训中心）、中国道路交通安全协会。
车辆管理所的主要职责：
负责办理机动车驾驶证申领、换发、审验、驾驶员档案管理，
负责办理机动车入户、过户、异动、检验与机动车号牌的发放以及机动车档案管理等工作。
资料链接：百度百科-车辆管理所
资料链接:百度百科-公安部交通管理局
