农村建房，由于邻里之间有土地纠纷，镇政府不批房产证怎么办

我家2011年在简阳农村建的房子，当时是个领了建房许可证的，因为地理问题，邻居要求我家要修一条水路，方便下雨天雨水排放，我家是修了的。但是隔壁的邻居就因为这条水路问题说我家占用了他家的地，说要毁了这条水路！经过乡上干部的测量，我们两家的土地面积都有多，因为以前那里有公路，路旁种了树子，后来那些树子砍了，每家人的土地自然就会多一些。但是那家邻居还是不罢休，好像靠关系叫镇政府不给我家批房产证，由于这样的邻里纠纷，我家一直没有拿到房产证！因为我们那里过几年可能会被占用，我父母都很着急，我们该怎么办才能拿到房产证啊？谢谢各位，帮忙解答一下！