360杀毒后，修复了的exe文件都不能用了，怎么办？？

我电脑中了一中什么蠕虫病毒，然后把我电脑所有的exe文件都感染了，现在360查出所有的exe都是木马，处理方式是修复文件，我试着修复了一些文件，但是，修复过的exe都不能用了，都是说什么不是有效的Win32应用程序。
这该怎么办，我电脑的软件很多，叫我全部重装，不可能吧，而且有些程序是我自己写的，装也装不回来，重做系统？重做的也是c盘吧。其它盘的不都是不能运行么？怎么办？