先在银行办理了抵押的房产后又被法院查封在银行拍买时会有影响吗

首先你的这个问题问的不是蛮清楚，按我的理解是不是：银行的拍卖行为是否会受到法院查封的影响？
既然已经进入到诉讼程序，那么不论申请拍卖一方为该银行还是其他人，拍卖必须经法院主持由房产所有人（即抵押人）、债权人、债务人各方选定资产评估机构、拍卖公司，进行拍卖。拍卖所得的价款，按你所说已经抵押给银行，那么先由该银行在其债权范围内受偿（也有可能拍卖公司先要提取佣金）；如有剩余拍卖款的，再由其他债权人受偿；最后如有剩余的，归房产所有人。