发票抬头为分公司，却由总公司支付了款项，分公司会计怎么处理这笔账务呢？

分公司需要交纳车船税及保险5000元，发票抬头为分公司名称，但总公司已经支付了这笔款项，作为分公司的会计应该怎么处理这张发票，分公司独立核算。是不管这张发票呢，还是做其他应付款挂账，税务局那边会不会出问题？

这个应该不成问题，分公司在法律上是不独立的，只是相当于总公司的一个部门。这和子公司不一样。所以抬头为分公司，总公司支付，这个只需要内部转移支付做一下就没有问题了，不会引起税务或者法律的什么问题。如可以这样处理，借：管理费用，贷：其他应收款（总公司）
这里做到其他应收款，是因为分公司与总公司的往来设定通过这个科目进行，你也可以做其他科目，根据你们公司自己的情况。当然我们在摘要里面需要说清楚，是总公司代付了这笔款项。追问

如果是子公司要怎么解决？我说的分总公司可能有歧义，付款公司是发票所开公司的控股者，那应该算是子公司吧。

追答

如果是子公司，那么这笔款支付就不对了，因为是法律上两个完全独立的公司。不过，可能总公司为子公司代付的业务不只这一项吧？毕竟是母公司与子公司，或者在税务上这样可以解释的清楚。不过还是需要把这笔款支付给母公司，母公司那边方可以消除这笔支付款，否则母公司那会出现挂账。作为两个在法律上独立的公司来说，最好不要出现这样的情况，否则对方也难以入账，因为所开发票抬头与收款是两家公司，税务上会认为是虚开发票行为。

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